1.北京大学 位于北京市海淀区
2.清华大学 位于北京市海淀区
3.上海交通大学 位于上海市闵行区
4.浙江大学 位于浙江省杭州市
5.华中科技大学 位于湖北省武汉市
6.南京大学 位于江苏省南京市
7.复旦大学 位于上海市杨浦区
8.西安交通大学 位于陕西省西安市
9.中国科学技术大学 位于安徽省合肥市
10.北京师范大学 位于北京市海淀区
清华大学，北京大学排名前二，没有任何质疑。接下来的五个是华东五校，即上海交通大学，复旦大学，浙江大学，中国科技大学和南京大学。第七名到第十名可能就没有那么一致了，大概在以下几个学校中产生:中国人民大学，华中科技大学，武汉大学，西安交通大学和哈尔滨工业大学。
全国39所985可以分为四个档次，第一档是清北，第二档是C9联盟其余7所大学，第三档是985工程一期除C9外的其余院校，第四档是985工程二期院校，尽管这样排序还存在一些争议，但也有一定借鉴意义。
第一档985：2所
清华、北大。清华大学和北京大学是全国知名的大学，也在世界范围内享有盛名，清华以工科为优势学科，北大以文科、基础学科、理科为优势学科，这两所大学每年都会招收很多各省高考状元。
第二档985：7所
全国985大学，
共有39所，
分别是：
清华大学、北京大学、中国人民大学、北京师范大学、北京理工大学、中国农业大学、中央民族大学、北京航空航天大学、复旦大学、上海交通大学、同济大学、华东师范大学、南开大学、天津大学、重庆大学、浙江大学、南京大学、东南大学、东北大学、大连理工大学、中南大学、国防科技大学、湖南大学、四川大学、电子科技大学、吉林大学、厦门大学、山东大学、中国海洋大学、武汉大学、华中科技大学、西安交通大学、西北工业大学、西北农林科技大学、中山大学、华南理工大学、中国科学技术大学、哈尔滨工业大学、兰州大学。
