根据2012年学科评估的结果，中国内地高校生物医学工程专业排名，第一名是东南大学，第二名是清华大学，第三名是上海交通大学、华中科技大学（并列），第五名是四川大学。后面的依次是：北京航空航天大学、浙江大学、重庆大学、西安交通大学、北京大学、电子科技大学、北京理工大学、天津大学、复旦大学、华南理工大学、重庆医科大学、首都医科大学、东北大学、同济大学、上海理工大学、中南大学、南方医科大学、太原理工大学、哈尔滨医科大学、西北工业大学、东华大学、温州医学院、湖南大学、上海大学、中南民族大学、***总医院（军医进修学院）、沈阳工业大学、大连海洋大学、长春理工大学、兰州大学、重庆理工大学。参评院校一共36所。有一些开设了这个专业但是没有参加评估的。
生物医学工程学科实力很强的大学主要有东南大学、华中科技大学、上海交通大学、清华大学、北京航空航天大学、浙江大学、四川大学、北京大学、天津大学、复旦大学、华南理工大学等。
目前教育部门并没有发布权威的生物医学科学专业大学排名，但是公布了基础医学学科大学排名情况，生物医学科学是基础医学类的下属专业。其中，北京大学、北京协和医学院被评为A+，复旦大学A，上海交通大学等4所高校被评为A-.
北京大学 A+
2 10003 清华大学 A+
3 ***8 上海交通大学 A+
4 10019 中国农业大学 A
5 10284 南京大学 A
6 10358 中国科学技术大学 A
7 10486 武汉大学 A
8 10504 华中农业大学 A
9 10055 南开大学 A-
10 10200 东北师范大学 A-
在科教评价网版生物科学专业大学排名中，生物科学专业排名第一的是浙江大学，排名第二的是四川大学，排名第三的是北京大学。还是要看自己兴趣了。生物科学（又称生命科学）专业包括了生物科学和生物技术两个专业方向，这些专业学科主要培养学生学习生物科学技术方面的基本理论、基本知识，学生将受到应用基础研究和技术开发方面的科学思维和科学实验训练，进而具有较好的科学素养及初步的教学、研究、开发与管理的基本能力。
师范类大学生物科学排名：
1、清华大学专业排名第1名 / 综合指数***.02学科评估A+
2、北京大学专业排名第2名 / 综合指数96.23学科评估A+
3、复旦大学专业排名第3名 / 综合指数94.4学科评估A-
4、中国科学院大学专业排名第4名 / 综合指数92.4***科评估A+
5、中国科学技术大学专业排名第5名 / 综合指数90.31学科评估A
6、南京大学专业排名第6名 / 综合指数89.81学科评估A
7、浙江大学专业排名第7名 / 综合指数89.41学科评估A-
全国生物科学专业大学排名榜（2022年最新）排名中师范类大学生物科学排名为：
1、 东北师大第10名，
2、 北京师范大学18名，
3、 首都师范大学19，
4、 华东师大22名，
5、 南京师大23名，
6、 陕西师范大学30名，
7、 河南师范大学42名，
8、 华中师范大学43名，
9、 湖南师范大学46名，
