15世纪末，由欧洲通往美洲的大西洋航道被哥伦布开辟，欧洲人纷纷远涉重洋来到美洲。17世纪初，首批英国移民到达北美，在那里开拓自己的“伊甸园”——新英格兰。移民中有100多名清***，曾在牛津和剑桥大学受过古典式的高等教育，为了让他们的子孙后代在新的家园也能够受到这种教育，他们于1636年在马萨诸塞州的查尔斯河畔建立了美国历史上第一所学府——哈佛学院。
1636年10月28日，马萨诸塞海湾殖民地议会通过决议，决定仿照英国剑桥大学，筹建一所高等学府，每年拨款400英镑；学校初名“新学院（New College）”或“新市民学院（the college at New Towne）”，成为全美第一所高等教育机构。
1638年9月14日，牧师兼伊曼纽尔学院院长的J．哈佛病逝，他把一半的积蓄720英镑和400余册图书捐赠给这所学校。
同年正式开学，第一届学生共9名。
1639年3月13日，为感谢以及纪念约翰·哈佛牧师在创立初期对学院的慷慨捐助，马萨诸塞海湾殖民地议会通过决议，将学校更名为“哈佛学院”。
1650年哈佛学院获准成立法人机构。
