排名是，清华大学，哈尔滨工业大学，同济大学，北京大学。清华大学，北京大学不愧为国内综合实力排名一，二名高校，综合实力很强，开设的专业几乎没有不好的专业，都是国内一流。哈尔滨工业大学，同济大学同样也是国内一流高校，但偏重于理工，实力也是很强大的。
不同年份，不同来源，化学专业排名前十的大学也有不同。整体看较稳定的有，北京大学，南开大学，南京大学，清华大学，厦门大学，中国科大，复旦大学，山东大学，兰州大学。
中国药科大学比较好。中国药科大学的王牌专业是药物化学和药剂学，是国家重点学科，处于国内领先地位。
中国药物化学专业研究生各高校排名（仅供参考）
等级1 中国药科大学 重庆大学 复旦大学 北京大学 武汉大学 广东药学院 沈阳药科大学 暨南大学 浙江工业大学 中国海洋大学 浙江大学 四川大学 山东大学
延边大学、郑州大学、中南大学、华东理工大学、青岛科技大学、上海交通大学、广西医科大学、天津大学、中山大学、重庆医科大学、河北医科大学、吉林大学、首都医科大学、河北科技大学、内蒙古医学院、南开大学、厦门大学、烟台大学、贵州大学、天津科技大学
1 北京大学
2 南开大学
3 南京大学
4 吉林大学
5 清华大学
6 厦门大学
7 中国科学技术大学
8 浙江大学
9 四川大学
10 湖南大学
